Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SRSF11Q05519 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SRSF11Q05519 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms