Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ERCC6Q03468 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ERCC6Q03468 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms