Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV1Q03135 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms