Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NRG1Q02297 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NRG1Q02297 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms