Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SPIBQ01892 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SPIBQ01892 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms