Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDR2Q01850 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDR2Q01850 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms