Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
OTUD4Q01804 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
OTUD4Q01804 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms