Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRCDQ00LT1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRCDQ00LT1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms