Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZBED6P86452 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZBED6P86452 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms