Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMAD3P84022 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMAD3P84022 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms