Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms