Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CSNK2A1P68400 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK2A1P68400 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms