Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM4P67936 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPM4P67936 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPM4P67936 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM4P67936 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TPM4P67936 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms