Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHOBP62745 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOBP62745 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOBP62745 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOBP62745 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOBP62745 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOBP62745 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOBP62745 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RHOBP62745 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHOBP62745 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms