Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTA2P62736 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTA2P62736 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms