Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRPFP62306 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms