Protein–RNA interactions for Protein: P61236

YPEL3, Protein yippee-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL3P61236 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
YPEL3P61236 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
YPEL3P61236 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms