Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNAP25P60880 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNAP25P60880 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms