Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DEFA3P59666 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DEFA3P59666 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms