Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHBDL3P58872 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL3P58872 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms