Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D1P54289 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACNA2D1P54289 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms