Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SUCLG1P53597 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SUCLG1P53597 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms