Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EFNA4P52798 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms