Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETV1P50549 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV1P50549 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV1P50549 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV1P50549 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms