Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A3P48751 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A3P48751 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms