Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
NESP48681 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NESP48681 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NESP48681 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
NESP48681 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
NESP48681 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NESP48681 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NESP48681 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NESP48681 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NESP48681 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NESP48681 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
NESP48681 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NESP48681 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NESP48681 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NESP48681 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NESP48681 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NESP48681 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
NESP48681 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NESP48681 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NESP48681 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NESP48681 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NESP48681 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NESP48681 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NESP48681 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NESP48681 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NESP48681 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NESP48681 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NESP48681 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NESP48681 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NESP48681 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NESP48681 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NESP48681 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
NESP48681 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NESP48681 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NESP48681 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NESP48681 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NESP48681 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NESP48681 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NESP48681 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NESP48681 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
NESP48681 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NESP48681 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NESP48681 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
NESP48681 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NESP48681 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NESP48681 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NESP48681 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NESP48681 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NESP48681 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NESP48681 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NESP48681 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NESP48681 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NESP48681 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.7 ms