Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA8P48165 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA8P48165 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA8P48165 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA8P48165 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA8P48165 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA8P48165 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA8P48165 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA8P48165 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms