Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC1A4P43007 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC1A4P43007 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms