Protein–RNA interactions for Protein: P42285

SKIV2L2, Superkiller viralicidic activity 2-like 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L2P42285 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L2P42285 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKIV2L2P42285 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKIV2L2P42285 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms