Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP8P40818 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP8P40818 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP8P40818 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP8P40818 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP8P40818 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP8P40818 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP8P40818 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP8P40818 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP8P40818 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP8P40818 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP8P40818 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP8P40818 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP8P40818 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP8P40818 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP8P40818 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP8P40818 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP8P40818 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP8P40818 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP8P40818 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP8P40818 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms