Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 GCV2YMR189W 3105 nt2.8□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 PFF1YBR074W 2931 nt2.8□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YBP1YBR216C 2025 nt2.8□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YDR239CYDR239C 2364 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 BNR1YIL159W 4128 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 HYP2YEL034W 474 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 SHE2YKL130C 741 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YKR033CYKR033C 426 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YAR029WYAR029W 225 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YPL229WYPL229W 621 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 STE5YDR103W 2754 nt2.79□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 ECM21YBL101C 3354 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 HEH2YDR458C 1992 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YIL169CYIL169C 2988 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 MET6YER091C 2304 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 RPS24AYER074W 408 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 PSY1YKL076C 384 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 FPR1YNL135C 345 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 PTC5YOR090C 1719 nt2.78□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 FIR1YER032W 2631 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 UBP11YKR098C 2154 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 RRP12YPL012W 3687 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 POL3YDL102W 3294 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 NCL1YBL024W 2055 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 PRK1YIL095W 2433 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 RPS22AYJL190C 393 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YOR050CYOR050C 348 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 RLI1YDR091C 1827 nt2.77□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YJL070CYJL070C 2667 nt2.76□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 ESL2YKR096W 3588 nt2.76□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 AIM9YER080W 1884 nt2.76□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 IPT1YDR072C 1584 nt2.76□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 MPH1YIR002C 2982 nt2.76□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 LSM7YNL147W 348 nt2.76□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.76□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 SIN3YOL004W 4611 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YBT1YLL048C 4986 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 PRP6YBR055C 2700 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YGL024WYGL024W 336 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YGL239CYGL239C 315 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 HSK3YKL138C-A 210 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 RTC6YPL183W-A 282 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 IKI3YLR384C 4050 nt2.75□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 TIM13YGR181W 318 nt2.74□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 RPL14BYHL001W 417 nt2.74□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 GRX8YLR364W 330 nt2.74□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 HCH1YNL281W 462 nt2.74□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YOR296WYOR296W 3870 nt2.74□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 RGC1YPR115W 3252 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 NUM1YDR150W 8247 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 QCR7YDR529C 384 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 RPL36AYMR194W 303 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 RKM1YPL208W 1752 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 SNU114YKL173W 3027 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 NOT5YPR072W 1683 nt2.73□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.72□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 ACM1YPL267W 630 nt2.72□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 SAK1YER129W 3429 nt2.72□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 YPL216WYPL216W 3309 nt2.71□□□□□ -1.97
SSZ1P38788 SGD1YLR336C 2700 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 BCK1YJL095W 4437 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YIL174WYIL174W 228 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 CRS5YOR031W 210 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 RPL33AYPL143W 324 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 snR42snR42 351 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YIL080WYIL080W 4722 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 SDC25YLL016W 3147 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 SWR1YDR334W 4545 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 SGM1YJR134C 2124 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 RTT10YPL183C 3042 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 SOK2YMR016C 2358 nt2.71□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 LRG1YDL240W 3054 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 TCB2YNL087W 3537 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 DOT6YER088C 2013 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 GEA1YJR031C 4227 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 HMRA2YCR096C 360 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 snR8snR8 190 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 FMP16YDR070C 282 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 UTP14YML093W 2700 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 HRD3YLR207W 2502 nt2.7□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 SUL1YBR294W 2580 nt2.69□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 SSN2YDR443C 4263 nt2.69□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YFL063WYFL063W 456 nt2.69□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.69□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.69□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 RPS27AYKL156W 249 nt2.69□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 TMA10YLR327C 261 nt2.69□□□□□ -1.98
SSZ1P38788 MRPL33YMR286W 261 nt2.69□□□□□ -1.98
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