Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRCA1P38398 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRCA1P38398 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms