Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP5C1P36542 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP5C1P36542 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms