Protein–RNA interactions for Protein: P36016

LHS1, Heat shock protein 70 homolog LHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LHS1P36016 YDL041WYDL041W 354 nt2.51□□□□□ -2.01
LHS1P36016 RTR1YER139C 681 nt2.51□□□□□ -2.01
LHS1P36016 HIT1YJR055W 495 nt2.51□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YLR287CYLR287C 1068 nt2.51□□□□□ -2.01
LHS1P36016 COX7YMR256C 183 nt2.51□□□□□ -2.01
LHS1P36016 DAD3YBR233W-A 285 nt2.51□□□□□ -2.01
LHS1P36016 VPS64YDR200C 1815 nt2.51□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YOL098CYOL098C 3114 nt2.51□□□□□ -2.01
LHS1P36016 SWT1YOR166C 1377 nt2.5□□□□□ -2.01
LHS1P36016 SVL3YPL032C 2478 nt2.5□□□□□ -2.01
LHS1P36016 NEW1YPL226W 3591 nt2.5□□□□□ -2.01
LHS1P36016 VOA1YGR106C 798 nt2.5□□□□□ -2.01
LHS1P36016 RPO41YFL036W 4056 nt2.5□□□□□ -2.01
LHS1P36016 VPS13YLL040C 9435 nt2.5□□□□□ -2.01
LHS1P36016 DIE2YGR227W 1578 nt2.49□□□□□ -2.01
LHS1P36016 SGS1YMR190C 4344 nt2.49□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YLR031WYLR031W 561 nt2.49□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.49□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YNL058CYNL058C 951 nt2.49□□□□□ -2.01
LHS1P36016 SDC25YLL016W 3147 nt2.49□□□□□ -2.01
LHS1P36016 PSK2YOL045W 3306 nt2.48□□□□□ -2.01
LHS1P36016 RNP1YLL046C 750 nt2.48□□□□□ -2.01
LHS1P36016 LCL2YLR104W 396 nt2.48□□□□□ -2.01
LHS1P36016 COQ10YOL008W 624 nt2.48□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YOR146WYOR146W 306 nt2.48□□□□□ -2.01
LHS1P36016 ROX1YPR065W 1107 nt2.48□□□□□ -2.01
LHS1P36016 COX1Q0045 1605 nt2.48□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YHR078WYHR078W 1659 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YSW1YBR148W 1830 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 CDC24YAL041W 2565 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 TMA10YLR327C 261 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YML037CYML037C 1023 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 YOR050CYOR050C 348 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 SSN2YDR443C 4263 nt2.47□□□□□ -2.01
LHS1P36016 GNT1YOR320C 1476 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 AYT1YLL063C 1425 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 GCV2YMR189W 3105 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 CAJ1YER048C 1176 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 URM1YIL008W 300 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 PRP6YBR055C 2700 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 BAS1YKR099W 2436 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 FKS3YMR306W 5358 nt2.46□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YJL070CYJL070C 2667 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 IPT1YDR072C 1584 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 PEX4YGR133W 552 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YMR324CYMR324C 243 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 LSM7YNL147W 348 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YPL238CYPL238C 390 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 HRD3YLR207W 2502 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 NAN1YPL126W 2691 nt2.45□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YPL150WYPL150W 2706 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 IRC10YOL015W 1761 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YPR089WYPR089W 2667 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 RPS20YHL015W 366 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YJL202CYJL202C 348 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 TMA22YJR014W 597 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 DNA2YHR164C 4569 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 RLI1YDR091C 1827 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 CSF1YLR087C 8877 nt2.44□□□□□ -2.02
LHS1P36016 MSL5YLR116W 1431 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 KRE33YNL132W 3171 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 snR79snR79 84 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 RTT102YGR275W 474 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 MPH1YIR002C 2982 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YOR121CYOR121C 306 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YPR197CYPR197C 564 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 VMA9YCL005W-A 222 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 PRK1YIL095W 2433 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 TRS130YMR218C 3309 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 FAR11YNL127W 2862 nt2.43□□□□□ -2.02
LHS1P36016 TOF1YNL273W 3717 nt2.42□□□□□ -2.02
LHS1P36016 RPL27BYDR471W 411 nt2.42□□□□□ -2.02
LHS1P36016 AYR1YIL124W 894 nt2.42□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YBL071CYBL071C 309 nt2.42□□□□□ -2.02
LHS1P36016 IRA2YOL081W 9240 nt2.41□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YER121WYER121W 345 nt2.41□□□□□ -2.02
LHS1P36016 RPS18BYML026C 441 nt2.41□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YOR055WYOR055W 435 nt2.41□□□□□ -2.02
LHS1P36016 KSP1YHR082C 3090 nt2.41□□□□□ -2.02
LHS1P36016 REV1YOR346W 2958 nt2.41□□□□□ -2.02
LHS1P36016 IRC8YJL051W 2469 nt2.41□□□□□ -2.02
LHS1P36016 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.4□□□□□ -2.03
LHS1P36016 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.4□□□□□ -2.03
LHS1P36016 ACB1YGR037C 264 nt2.4□□□□□ -2.03
LHS1P36016 PAU14YIL176C 363 nt2.4□□□□□ -2.03
LHS1P36016 PAU1YJL223C 363 nt2.4□□□□□ -2.03
LHS1P36016 GRX8YLR364W 330 nt2.4□□□□□ -2.03
LHS1P36016 RPS1AYLR441C 768 nt2.4□□□□□ -2.03
LHS1P36016 CRS5YOR031W 210 nt2.4□□□□□ -2.03
LHS1P36016 UBP11YKR098C 2154 nt2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 36.3 ms