Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXD12P35452 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD12P35452 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms