Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.958e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.928e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.888e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ARHGAP22-207ENST00000460425 2764 ntTSL 220.14■□□□□ 0.828e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.568e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.374e-10■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.844e-10■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AC073046.1-201ENST00000441217 390 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.344e-14■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AC135048.1-202ENST00000562642 626 ntTSL 38.52□□□□□ -1.054e-14■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.665e-8■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 RBX1-203ENST00000476110 574 ntTSL 211.11□□□□□ -0.635e-8■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 AC084125.2-204ENST00000527086 556 ntTSL 414.58□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 419.98■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.147e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 320.89■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 520.89■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 518.83■□□□□ 0.61e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 511□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.541e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.355e-7■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 FAM19A5-205ENST00000473898 897 ntTSL 222.12■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 FAM19A5-201ENST00000336769 546 ntTSL 413.43□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 29.2
GTF2F1P35269 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.761e-7■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 ADD1-213ENST00000508684 3059 ntTSL 224.7■■□□□ 1.551e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 ADD1-214ENST00000509039 1569 ntTSL 211.88□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 EHBP1-213ENST00000462441 332 ntTSL 35.13□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 POLR1A-210ENST00000496892 546 ntTSL 415.6■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 POLR1A-209ENST00000492034 588 ntTSL 414.61□□□□□ -0.074e-9■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.724e-9■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.174e-9■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 RAC2-205ENST00000441619 705 ntTSL 59.54□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.93e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 PHF23-211ENST00000574899 370 ntTSL 326.06■■□□□ 1.765e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 PHF23-208ENST00000574236 583 ntTSL 326.06■■□□□ 1.765e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.695e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.495e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-207ENST00000439835 572 ntTSL 423.35■■□□□ 1.335e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.185e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.885e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-213ENST00000455233 671 ntTSL 320.21■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-209ENST00000445110 512 ntTSL 420.04■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.655e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.265e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-205ENST00000411478 568 ntTSL 415.75■□□□□ 0.115e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 DNM2-212ENST00000588976 536 ntTSL 515.3■□□□□ 0.045e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 DNM2-207ENST00000586939 551 ntTSL 413.01□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 29.1
GTF2F1P35269 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.289e-8■■■■■ 29
GTF2F1P35269 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 516.79■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 29
GTF2F1P35269 FNDC3B-206ENST00000443501 678 ntTSL 39.57□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.945e-21■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 PURA-202ENST00000502351 502 ntTSL 229.4■■■□□ 2.34e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 PURA-203ENST00000505703 597 ntTSL 328.88■■■□□ 2.214e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 TYK2-213ENST00000529739 842 ntTSL 219.38■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 TYK2-214ENST00000530220 767 ntTSL 314.95□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 TYK2-221ENST00000592137 536 ntTSL 314.37□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 TYK2-215ENST00000530560 558 ntTSL 313.36□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 TYK2-212ENST00000529422 622 ntTSL 512.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 TYK2-208ENST00000527481 628 ntTSL 310.44□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.361e-17■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 PPP2CB-207ENST00000520500 603 ntTSL 47□□□□□ -1.291e-17■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 PPP2CB-202ENST00000518243 577 ntTSL 34.84□□□□□ -1.631e-17■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 BCL2L1-205ENST00000422920 1157 ntTSL 228.61■■■□□ 2.175e-8■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 BCL2L1-209ENST00000456404 914 ntTSL 220.03■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 BCL2L1-207ENST00000439267 781 ntTSL 213.85□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 BCL2L1-204ENST00000420488 820 ntTSL 211.97□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 BCL2L1-206ENST00000434194 381 ntTSL 38.4□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 EML6-207ENST00000491655 471 ntTSL 423.33■■□□□ 1.336e-8■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 ZNF544-202ENST00000594303 539 ntTSL 421.62■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 ZNF544-210ENST00000597240 555 ntTSL 514.4□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 ZNF544-213ENST00000599227 3587 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 28.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 393.8 ms