Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CXCR5P32302 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR5P32302 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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