Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CPS1P31327 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CPS1P31327 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CPS1P31327 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CPS1P31327 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPS1P31327 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPS1P31327 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPS1P31327 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPS1P31327 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPS1P31327 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CPS1P31327 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPS1P31327 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms