Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA1P29973 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA1P29973 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms