Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PEX2P28328 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PEX2P28328 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PEX2P28328 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PEX2P28328 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PEX2P28328 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms