Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXP28300 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXP28300 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXP28300 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LOXP28300 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXP28300 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXP28300 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXP28300 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXP28300 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXP28300 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LOXP28300 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LOXP28300 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LOXP28300 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LOXP28300 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LOXP28300 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms