Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LAMA1P25391 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAMA1P25391 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms