Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KDELR1P24390 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms