Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA2P24043 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LAMA2P24043 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms