Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPREP23469 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPREP23469 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPREP23469 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPREP23469 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
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