Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PRKACBP22694 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PRKACBP22694 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms