Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCP2P22307 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCP2P22307 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCP2P22307 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2P22307 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2P22307 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCP2P22307 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms