Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERBB3P21860 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERBB3P21860 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms