Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EPHA1P21709 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms