Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CD247P20963 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CD247P20963 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CD247P20963 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CD247P20963 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CD247P20963 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CD247P20963 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms